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基因組錯誤折疊或提供新的癌癥研究思路

更新時間:2015-12-25      瀏覽次數(shù):406

近日,發(fā)表在Nature雜志上的一篇研究論文中,來自麻省總醫(yī)院和博德研究所的科學(xué)家揭示了隱藏在癌癥背后的一種新型生物學(xué)機(jī)制,文章中,通過對攜帶異檸檬酸脫氫酶基因(IDH)突變的腦瘤進(jìn)行研究,研究者揭開了指導(dǎo)基因組自身折疊指令的罕見改變,這些指令改變可以靶向作用基因組的關(guān)鍵部分—絕緣子,絕緣子可以抑制某個區(qū)域的基因同控制開關(guān)及附近區(qū)域的特殊基因發(fā)生相互作用,當(dāng)這些絕緣子在IDH突變的腫瘤中“胡作非為”時,期就會促進(jìn)一系列生長因子基因被基因開關(guān)所控制,zui終形成強(qiáng)大的促癌組合,相關(guān)研究貨位后期開發(fā)新型的抗癌療法提供思路。

研究人員Bradley Bernstein表示,我們揭示了癌癥發(fā)生的一種機(jī)制,而且我們認(rèn)為這種機(jī)制不僅僅存在于腦瘤中;如今科學(xué)家們可以確定促癌基因會通過DNA序列的改變而出現(xiàn)異常的激活,而在本文中研究人員則發(fā)現(xiàn),促癌基因會通過基因組折疊的改變來被開啟。

這項(xiàng)研究中,研究人員對神經(jīng)膠質(zhì)瘤進(jìn)行了深入研究,神經(jīng)膠質(zhì)瘤是一種腦癌,當(dāng)然其還包括惡性的膠質(zhì)母細(xì)胞瘤,在過去20年里治療這種惡性腦瘤的療法并沒有太大進(jìn)展,因此為了解開這種腦瘤的發(fā)生機(jī)制,研究者Bernstein就同其同事對近年來癌癥基因組的大量數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,他們檢測了IDH突變的腫瘤的發(fā)展趨勢,當(dāng)名為PDGFRA的生長因子基因被開啟時,遠(yuǎn)端基因FIP1L1就會被開啟,而PDGFRA被關(guān)閉時,F(xiàn)IP1L1基因也會被關(guān)閉。

很長一段時間以來,IDH突變的腫瘤發(fā)生的機(jī)制并沒有被很好地分析,IDH基因可以編碼一種特殊酶類,當(dāng)其突變后就會產(chǎn)生一種毒性的代謝產(chǎn)物,進(jìn)而干擾其它不同種類蛋白質(zhì)的產(chǎn)生,然而具體是什么機(jī)制改變引發(fā)了癌癥研究人員并不清楚。研究者發(fā)現(xiàn),基因組上的絕緣子可以通過多種蛋白的作用進(jìn)行結(jié)合,隨后結(jié)合到基因組中名為CTCF的區(qū)域。

文章中,利用多種基因組尺度的方法進(jìn)行結(jié)合,研究者發(fā)現(xiàn),在IDH突變的神經(jīng)膠質(zhì)瘤中,超甲基化可以在CTCF區(qū)域集中,結(jié)合他們早期的研究成果,他們發(fā)現(xiàn),PDGFRA和FIP1L1在正常情況下處于不同的結(jié)構(gòu)域中,而且?guī)缀醪粫l(fā)生相互作用,但二者在IDH突變的腫瘤中卻是關(guān)系比較密切的,這種不尋常的關(guān)系往往是超甲基化所引起的。

zui后Bernstein說道,攜帶IDH突變的腫瘤還有很多,比如白血病、結(jié)腸癌、膀胱癌等等,本文研究為后期進(jìn)行多種癌癥發(fā)病機(jī)理的研究都提供了新的線索和研究數(shù)據(jù)。(

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